Wissenschaftler haben eine Familie einzigartiger kurzer Wiederholungen im Schweinegenom entdeckt, die evolutionäre Ähnlichkeiten mit ähnlichen Wiederholungen bei Primaten aufweist.
Wissenschaftler der Jilin University (Changchun, China) und der Akademie der Agrarwissenschaften (Heilongjiang, China) nahmen in Zusammenarbeit mit der Firefly BioWorks Corporation (USA) an dem Projekt teil.
Nach Analyse der Struktur und Herkunft von PRE-1 (Schweine-Wiederholungselement, wörtlich "Schweine-Wiederholungselement") kamen sie zu dem Schluss, dass die nächsten Verwandten von Primaten auf dem ehemaligen Superkontinent Laurasia Schweine sein könnten. Der Forschungsvorabdruck wurde am 31. August 2015 auf dem bioRxiv-Server veröffentlicht.
Das untersuchte CDP (Short Dispersed Repeat) PRE-1 befindet sich in der intergenen Region, ungefähr 686 bis 985 Basenpaare vor dem Start des Gens, das das Insulinwachstumsfaktor-Bindungsprotein (IGFBP7) codiert. Die wiederholte PRE-1-Sequenz von 299 Basenpaaren wurde mit 40 verschiedenen Alu-Wiederholungen von Primaten verglichen, und signifikante Ähnlichkeiten wurden sowohl in den Sequenzen selbst als auch im Muster der Verteilung ihrer Wiederholungen über Chromosomen gefunden.
Die vorhergesagte Sekundärstruktur der RNA-Wiederholungen PRE-1 faltete sich zu einem Modell ähnlich den Alu-Wiederholungen. Schließlich deutete der gemeinsame Ursprung von PRE-1 und Alu aus der sogenannten 7SL-RNA (Signalerkennungs-RNA) auf ihre evolutionäre Ähnlichkeit hin und führte Schweine auf die Familie zurück, zu der hauptsächlich Primaten gehören.
Bisher stützten sich die Wissenschaftler beim Bau phylogenetischer Bäume nur auf die Ähnlichkeiten und Unterschiede der Gene und ignorierten die Tatsache, dass im Verlauf der Evolution das gesamte Genom Veränderungen durchlief, einschließlich der Elemente, die keine Proteine oder RNA codieren und deren Bedeutung den Wissenschaftlern noch weitgehend unklar ist.
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Diese Studie, die auf einem integrierten Ansatz zur Analyse intergener Elemente basiert, liefert nach Ansicht der Autoren "sehr überzeugende" Fakten, aus denen evolutionäre Schlussfolgerungen gezogen werden können. Insbesondere verschiebt sich nach diesen Ergebnissen die geschätzte Zeit der Divergenz der Arten vor 65 Jahren auf 80 bis 100 Millionen Jahre.
