Bericht über die Ergebnisse der genetischen Analyse von Gewebeproben von in Peru gefundenen Mumien. Dieser Bericht wurde im November 2018 erstellt.
Darsteller
- CEN4GEN-Labore (6756 - 75 Street NW Edmonton, AB Kanada T6E 6T9) - Probenvorbereitung und -sequenzierung.
- ABRAXAS BIOSYSTEMS SAPI DE CV (Mexiko) - Computerdatenanalyse.
Nach einer vorläufigen Qualitätsanalyse wurden 3 Proben von 7 eingereichten Proben zur weiteren Analyse entnommen.
Proben zur Analyse
| Bezeichnung | Originalname | Bedingter Name | Bild |
| Ancient-0002 | Neck Bone Med Seated 00-12 Victoria 4 | Victoria | Abb. 3.117 |
| Ancient-0003 | 1 Hand 001 | Hand mit 3 Fingern trennen | Abbildung 3.118 |
| Ancient-0004 | Momia 5 - DNA | Victoria | Abb. 3.117 |
Für diese Proben wurden die folgenden Operationen durchgeführt:
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- Extraktion von DNA.
- DNA-Qualitätsprüfung.
- DNA-Vermehrung.
- Erstellung einer DNA-Bibliothek.
- DNA-Sequenzierung.
- Bildung gereinigter sequenzierter Daten.
- Qualitätskontrolle.
- Vorläufige Analyse durch Überlagerung von DNA-Reads auf dem menschlichen Genom.
- Die Analyse zur Isolierung von kurzer DNA liest sich typisch für alte DNA.
- Überlagerung von Ancient0003-DNA liest auf vorhandenen menschlichen Genombibliotheken.
- Mitochondrienanalyse zum Nachweis von D-Loop-Varianten und andere informative Stellen zur Bestimmung mitochondrialer Haplotypen.
- Bestimmung des Geschlechts der Proben Ancient0003.
- Identifizierung möglicher Fremdorganismen in Proben.
- Analyse von DNA-Datenbanken zur Identifizierung von Ähnlichkeiten mit bekannten Organismen.
Abbildung 3.117. Entnahme von Proben aus Victorias Hals.
Um mögliche Arten von Organismen zu identifizieren, die in den Proben Ancient0004 und Ancient0002 (Victoria) vorhanden sind, wurde eine genomische DNA-Skizze durchgeführt (Ondov et al., 2016), in der Gruppen von kurzen Fragmenten, k-mers, mit den verfügbaren Datenbanken verglichen wurden. Die BBTools-Software wurde verwendet.
Die folgenden Organismen wurden getestet:
- Bakterien.
- Virus.
- Plasmide.
- Phagen.
- Pilze.
- Plastid.
- Kieselalgen.
- Mensch.
- Bos Stier.
- H penzbergensis.
- PhaseolusVulgaris.
-
Mix2: Label für folgende Genome:
- Lotus japonicus Chloroplast, vollständiges Genom.
- Canis lupus familiaris cOR9S3P olfaktorische Rezeptorfamilie 9 Unterfamilie S Pseudogen (cOR9S3P) auf Chromosom 25.
- Vigna radiata Mitochondrion, vollständiges Genom.
- Millettia pinnata Chloroplast, vollständiges Genom.
- Curvibacter lanceolatus ATCC 14669 F624DRAFT_scaffold00015.15, Schrotflintensequenz des gesamten Genoms.
- Asinibacterium sp. OR53 scaffold1, Shotgun-Sequenz des gesamten Genoms.
- Bacillus firmus Stamm LK28 32, Schrotflintensequenz des gesamten Genoms.
- Bupleurum falcatum Chloroplast, vollständiges Genom.
- Alicycliphilus sp. B1, Schrotflintensequenz des gesamten Genoms.
- Bacillus litoralis Stamm C44 Scaffold1, Schrotflintensequenz des gesamten Genoms.
- Chryseobacterium takakiae Stamm DSM 26898, Schrotflintensequenz des gesamten Genoms.
- Paenibacillus sp. FSL R5-0490.
- Bacillus halosaccharovorans Stamm DSM 25387 Scaffold3, Shotgun-Sequenz des gesamten Genoms.
- Rhodospirillales-Bakterium URHD0017, Shotgun-Sequenz des gesamten Genoms.
- Bacillus onubensis Stamm 10J4 10J4_trimmed_contig_26, Shotgun-Sequenz des gesamten Genoms.
- Radyrhizobium sp. MOS004 mos004_12, Schrotflintensequenz des gesamten Genoms.
- Bacillus sp. UMB0899 ERR1203650.17957_1_62.8, Schrotflintensequenz des gesamten Genoms.
-
Wirbeltiere: Markierung für folgende Genome:
- Amblyraja-radiata_sAmbRad1_p1.fasta.
- bStrHab1_v1.p_Kakapo.fasta.
- bTaeGut1_v1.p_ZebraFinch.fasta.
- GCA_000978405.1_CapAeg_1.0_genomic_CapraAegagrus.fna.
- GCA_002863925.1_EquCab3.0_genomic_Horse.fna.
- GCF_000002275.2_Ornithorhynchus_anatinus_5.0.1_genomic.fna.
- GCF_000002285.3_CanFam3.1_genomic.fna.
- Macaco_GCF_000772875.2_Mmul_8.0.1_genomic.fna.
- rGopEvg1_p1_Gopherus_evgoodei_tortuga.fasta.
- Protozoen.
Abbildung 3.118. Bild und Röntgenaufnahme von zwei Händen mit drei Fingern.
Nach allen Filtern wurden 27974521 Lesevorgänge für Ancient0002 und 304785398 Lesevorgänge für Ancient0004 empfangen. Dies zeigt, dass 27% der DNA aus der Ancient0002-Probe und 90% der DNA aus der Ancient0004-Probe nicht mit den DNA-Proben der analysierten Organismen aus den verfügbaren Datenbanken identifiziert werden können.
Die nächste Stufe der Analyse wurde mit der Software Megahit v1.1.3 durchgeführt (Li et al., 2016). Das folgende Ergebnis wurde erhalten:
- Ancient0002: 60852 Contigs, insgesamt 50459431 bp, min 300 bp, max 24990 bp, durchschnittlich 829 bp, N50 868 bp, 884,385 (5,39%) zusammengesetzte Lesevorgänge.
- Ancient0003: 54273 Contigs, insgesamt 52727201 bp, min 300 bp, max 35094 bp, durchschnittlich 972 bp, N50 1200 bp, 20.247.568 (65,69%) zusammengesetzte Lesevorgänge.
Das Analyseergebnis ist in der Abbildung dargestellt.
Abbildung 3.116. Verhältnis der klassifizierten Lesevorgänge für 28073655 Ancient0002-Lesevorgänge (oberes Diagramm) und 25084962 Ancient0004-Lesevorgänge (unteres Diagramm) im Vergleich zur 34904805-DNA-Basis, die 1109518 taxonomische Gruppen darstellt.
Fazit
Als Ergebnis der Analyse wurde gezeigt, dass die Proben Ancient0002 und Ancient0004 (Victoria) nicht dem menschlichen Genom entsprechen, während die Ancient0003-Probe gut dem menschlichen entspricht.
Kommentar von Korotkov K. G
Beachten Sie, dass die Hand mit drei Fingern zu einer großen Kreatur gehörte, deren Größe mit der von Maria vergleichbar war, und das erhaltene Ergebnis dem Ergebnis der DNA-Analyse von Maria entspricht. Victoria ist ein Vertreter von "kleinen Kreaturen", und das Ergebnis zeigt, dass ihre DNA keiner modernen irdischen Kreatur entspricht. Natürlich haben wir keine Daten über alte Kreaturen, die über Millionen von Jahren verschwunden sind.
Links
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Materialien zur Verfügung gestellt von Konstantin Georgievich Korotkov (Doktor der Technischen Wissenschaften, Professor, Universität für Informationstechnologien, Mechanik und Optik) und Dmitry Vladislavovich Galetsky (Kandidat der medizinischen Wissenschaften, I. P. Pavlov Erste Staatliche Medizinische Universität St. Petersburg)
