Die Teilnehmer des Genome 10K-Konsortiums auf der Jahreskonferenz, die jetzt in New York stattfindet, kündigten den Start des internationalen Projekts "Vertebrate Genomes" an, dessen Aufgabe es ist, die Genome aller heute auf dem Planeten lebenden 66.000 Wirbeltierarten zu sammeln. Gizmodo erzählt mehr über die Ziele des Projekts.
2009 gründeten die amerikanischen Biologen David Haussler, Oliver Ryder und Stephen O'Brien das Genome 10K-Projekt, dessen Ziel es war, 10.000 Genome von Wirbeltieren zu sequenzieren. Zunächst nahmen 55 Wissenschaftler aus großen Zoos, Forschungszentren und Museen an dem Projekt teil. Zunächst war unklar, wie lange es dauern würde, Genome von ausreichender Qualität zusammenzusetzen. Mit den Kosten und der Vereinfachung der Sequenzierungsmethoden wurde jedoch klar, dass das Projekt seine Aufgaben in wenigen Jahren erfüllen würde. In den letzten drei Jahren haben die Projektteilnehmer die Haupttechnologien für die DNA-Sequenzierung und Analyse der erhaltenen Ergebnisse verglichen, um diejenige auszuwählen, die "Platin-Genome" erzeugt.
Gestern gaben Genome 10K-Mitglieder den Start eines neuen Wirbeltiergenomprojekts bekannt, das darauf abzielt, das männliche und weibliche Genom von 66.000 Wirbeltierarten zu sammeln. An dem Projekt werden 150 Wissenschaftler aus 50 Organisationen aus 12 Ländern beteiligt sein. Laut einem der Gründer des Projekts, Oliver Ryder, werden Biologen in der Lage sein, die Gründe für das Aussterben von Arten zu verstehen, einschließlich der Frage, ob es in der Geschichte der Art eng verwandte Kreuzungen gegeben hat, "Engpässe", aufgrund derer die genetische Vielfalt der Arten abgenommen hat, oder Deletionen - Mutationen, die sich "ausschalten" können »Gene, die für das Überleben des Organismus notwendig sind.
Zusammen mit der Ankündigung des neuen Projekts präsentierten die Wissenschaftler sofort die ersten Ergebnisse seiner Arbeit: das Genom von 15 Wirbeltierarten, darunter der vom Aussterben bedrohte Kakapo-Eulenpapagei, der in Neuseeland endemisch ist, und das australische Schnabeltier. Diese und alle anderen Genome, die die Forscher sammeln möchten, werden öffentlich in der Genomdatenbank der Arche Noah veröffentlicht.
Die Teilnehmer planen, kurze Abschnitte genomischer DNA zu sequenzieren und immer längere Sequenzen von ihnen bis zum gesamten Chromosom zu sammeln und sie dann mit speziell für das Projekt entwickelten Algorithmen zu "kleben".
Zuvor konnten Forscher das Genom einer Person auf einem Taschensequenzer in Smartphone-Größe lesen. Das Gerät stellte den Rekord für die längste Ablesung eines DNA-Moleküls auf und konnte Sequenzen mit bis zu 882.000 Basenpaaren sequenzieren.
Ekaterina Rusakova
